| 2021年10月8日西甲直播肿瘤精准检测与转化中心正式运行，开展高通量基因测序、PCR、流式细胞诊断、FISH等多项检测项目，可针对肿瘤患者在风险分层、早期筛查、良恶性判断、分子分型、用药指导、疗效评估、安全性预测及复发进展监控等方面的需求提供完整的解决方案。
该中心将建设集肿瘤基因检测、细胞表型分析、样本收集存储、生物信息解读、大数据处理挖掘和研发转化为一体的综合性平台，为临床肿瘤患者的精准治疗提供保障和服务。目前，中心项目覆盖肺癌、乳腺癌、消化系统肿瘤、泌尿系统肿瘤、妇科肿瘤、神经系统肿瘤、血液系统肿瘤、淋巴瘤等各类型肿瘤，可提供肿瘤多基因突变及免疫相关综合检测。
患者于中心进行检测后，检测报告可由主管医生通过院内系统直接读取、分析解读，既快捷高效、又科学可靠。
一、高通量基因测序（二代测序）检测简介
1、什么是NGS检测？
二代测序技术( Next-generation sequencing，NGS) 是新一代灵敏度较高的基因检测手段。相较于传统一代测序一次只能检测几个已知位点，NGS检测可以使用少量样本，一次性检测多个基因，全面了解众多基因的突变信息（图1），避免错失治疗机会，NGS检测不但能发现已知突变，对于未知突变检测也具有优势[1-2]。
除了传统的肿瘤组织样本，还可以通过血液、脑脊液等“液体活检”的方式了解肿瘤特有突变信息。所谓“液体活检”，是指针对血液、脑脊液等体液中含有的癌细胞DNA，即循环DNA（ctDNA）的检测[3]。
图1 基因突变类型：点突变，缺失插入，融合，拷贝数变化
2、NGS检测有什么价值？
《NCCN指南》推荐分子检测技术用于肿瘤治疗[4]
NCCN是世界顶级癌症中心组成的非营利性学术联盟，其制订的《NCCN肿瘤学临床实践指南》不仅是美国肿瘤领域临床决策的标准，也已成为全球肿瘤临床实践中应用最为广泛的指南，在中国也得到了广大肿瘤医生的认可与青睐。
• 指南推荐肺癌患者进行EGFR、ALK、ROS1、BRAF等检测，且强烈推荐高通量分子检测，针对靶向治疗后复发的患者，再次检测可以更好的指导靶向治疗
• 指南推荐乳腺癌患者进行HER2、BRCA1/2等检测
• 指南推荐结直肠癌患者RAS检测、MMR/MSI状态等检测
……
2020年12月28日，国家卫健委发布了《抗肿瘤药物临床应用管理办法（试行）》明确指出：
医师应当根据组织或细胞学病理诊断结果，或特殊分子病理诊断结果，合理选用抗肿瘤药物。对于有明确基因靶点的药物，必须遵循靶点基因检测后方可使用的原则。
靶向药物，顾名思义就是能够“精准打击”发生特定基因突变的位点，杀死肿瘤细胞的同时，又不会杀伤周围的正常组织细胞。
但是肿瘤靶向治疗的耐药性，其实是一个不可避免的重要问题。
肿瘤细胞的基因组是不稳定的，基因是可以持续突变的，也就是说，随着靶向治疗时间的推移，肿瘤患者可能会出现新的不同突变，进而产生耐药并导致疾病的进展。所以加强对肿瘤细胞耐药发生机制及其对策的研究，并提供克服耐药性的治疗策略则非常重要。
对于有明确耐药基因变异的药物，耐药后通过肿瘤基因检测确定肿瘤分子分型，筛选出适用于该分型的靶向药物，针对不同耐药机制制定疗效好、低毒副作用的治疗方案，采取相应的应对策略，增加患者获益可能。
通过基因检测可以获得与免疫治疗疗效相关的基因信息，指导免疫用药。比如结直肠癌MSI-H、TMB-H的患者能从免疫治疗中获益。
而特定基因突变的患者进行免疫治疗可能会疗效差或引起超进展，需要谨慎采取免疫治疗等[4]。
基因检测可涵盖与靶向治疗、免疫治疗、内分泌治疗等相关的基因位点，提示治疗方案的有效性和毒副作用，帮助患者更加合理的选择药物[4,5]。
研究表明，基因检测可以早于影像学检查数月提示肿瘤复发，使患者能尽早接受干预。
通过存在于外周血的肿瘤DNA检测，可以监测微小残留病灶，提示复发风险[4]。
大约5-10%的癌症是遗传造成的[6]，其中乳腺癌、卵巢癌、胃肠道癌症、胰腺癌、前列腺癌的遗传因素占重要作用，通过肿瘤遗传基因检测，可以有效评估肿瘤的遗传性，帮助患者家属明确患癌风险，提早预防[4,5]。
3、二代测序检测适用的人群？
1）诊断为癌症的患者：
需制定靶向治疗方案的患者；
靶向治疗耐药的患者；
寻求免疫治疗的患者；
晚期化疗阶段或复发难治寻求跨适应症用药患者。
2）有癌症家族史的人群[7]：
当家族中存在以下情况时，家族成员需要考虑进行癌症风险方面的基因检测：
几个亲属有相同或相关的肿瘤，亲属发病年龄较低（小于50岁），多发性或双侧性肿瘤，多原发肿瘤；
家族中有人患乳腺癌、卵巢癌、胃肠道癌症、胰腺癌、前列腺癌等遗传因素相关肿瘤。
二、NGS检测适用送检样本的类型
肿瘤的二代测序检测项目，原则上应当送检受累部位的样本，遗传病的检测可以选择外周血进行检测（表1）。
表1 NGS项目使用的样本类型
肿瘤精准检测与转化中心开展了多种高通量测序检测项目，患者可以在医生的指导下根据不同的样本类型选择合适的检测项目。琳琅满目的检测项目具有什么检测意义和价值？让我们一起揭开“他们”的面纱。
三、肿瘤精准检测与转化中心NGS检测项目
肿瘤精准检测与转化中心开展了多种高通量测序检测项目，患者可以在医生的指导下根据不同的样本类型选择合适的检测项目。琳琅满目的检测项目具有什么检测意义和价值？让我们一起揭开“他们”的面纱。
A-实体肿瘤检测项目
实体肿瘤高通量测序检测项目主要适用于以下人群：①需制定靶向治疗方案的患者；②靶向治疗耐药的患者；③寻求免疫治疗的患者；④晚期化疗阶段或复发难治寻求跨适应症用药患者。
B-肺癌检测项目
肺癌高通量测序检测项目主要适用于以下人群：①需制定靶向治疗方案的肺癌患者；②靶向治疗耐药的肺癌患者；③手术后观察复发的肺癌患者
C-乳腺癌检测项目
乳腺癌高通量测序检测项目主要适用于以下人群：①需制定个体化治疗方案的乳腺癌患者；②靶向治疗耐药的乳腺癌患者；③手术后观察复发的乳腺癌患者
D-消化系统肿瘤检测项目
消化系统肿瘤高通量测序检测项目主要适用于以下人群：①需制定个体化治疗方案的消化系统肿瘤患者；②靶向治疗耐药的消化系统肿瘤患者；③手术后观察复发的消化系统肿瘤患者
E-肝胆肿瘤检测项目
肝胆肿瘤高通量测序检测项目主要适用于以下人群：①需制定个体化治疗方案的肝胆肿瘤患者；②靶向治疗耐药的肝胆系统肿瘤患者；③探寻免疫治疗机会的食管癌患者；④手术后观察复发的肝胆系统肿瘤患者
F-食管癌检测项目
食管癌高通量测序检测项目主要适用于以下人群：①需制定个体化治疗方案的食管癌患者；②靶向治疗耐药的食管癌患者；③探寻免疫治疗机会的食管癌患者；④手术后观察复发的食管癌患者
G-胰腺癌检测项目
胰腺癌高通量测序检测项目主要适用于以下人群：①需制定个体化治疗方案的胰腺癌患者；②靶向治疗耐药的胰腺癌患者；③探寻免疫治疗机会的胰腺癌患者；④手术后观察复发的胰腺癌患者
H-妇科肿瘤检测项目
妇科肿瘤高通量测序检测项目主要适用于以下人群：①需制定个体化治疗方案的妇科肿瘤患者；②靶向治疗耐药的妇科肿瘤患者；③探寻免疫治疗机会的妇科肿瘤患者；④手术后观察复发的妇科肿瘤患者
I-泌尿系统肿瘤检测项目
泌尿系统肿瘤高通量测序检测项目主要适用于以下人群：①需制定个体化治疗方案的泌尿系统肿瘤患者；②靶向治疗耐药的泌尿系统肿瘤患者；③探寻免疫治疗机会的泌尿系统肿瘤患者；④手术后观察复发的泌尿系统肿瘤患者
J-甲状腺癌检测项目
甲状腺癌高通量测序检测项目主要适用于以下人群：①需制定个体化治疗方案的甲状腺癌患者；②靶向治疗耐药的甲状腺癌患者；③手术后观察复发的甲状腺癌患者
K-神经系统肿瘤检测项目
神经系统肿瘤高通量测序检测项目主要适用于以下人群：①需制定个体化治疗方案的神经系统肿瘤患者；②标准治疗失败或耐药复发的神经系统肿瘤患者
L-淋巴瘤检测项目
淋巴瘤高通量测序检测项目主要适用于以下人群：需制定个体化治疗方案的淋巴瘤肿瘤患者
M-血液系统肿瘤检测项目
血液系统肿瘤高通量测序检测项目主要适用于以下人群：需制定个体化治疗方案的血液系统肿瘤患者
N-遗传性肿瘤检测项目
遗传性肿瘤高通量测序检测项目主要适用于医生评估认为有潜在遗传风险的高危人群。
参考资料：
[1] Van Dijk E L, Auger H, Jaszczyszyn Y, et al. Ten years of next-generation sequencing technology[J]. Trends in genetics, 2014, 30(9): 418-426.
[2] Tan O, Shrestha R, Cunich M, et al. Application of next-generation sequencing to improve cancer management: A review of the clinical effectiveness and cost-effectiveness[J]. Clinical genetics, 2018, 93(3): 533-544.
[3] Wan J C M, Massie C, Garcia-Corbacho J, et al. Liquid biopsies come of age: towards implementation of circulating tumour DNA[J]. Nature Reviews Cancer, 2017, 17(4): 223-238.
[4] NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology. Version 3.2021.
[5] 中国临床医学会（CSCO）诊疗指南2020.
[6] Family history and inherited cancer genes. Cancer research UK.
[7] Rahman N. Realizing the promise of cancer predisposition genes[J]. Nature, 2014, 505(7483): 302-308.
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